Las iglesias congregacionales y unitarias se volvieron prominentes en Connecticut. Llamado hoy el "padre de Connecticut," Thomas Hooker era un personaje sobresaliente en el desarrollo temprano de Nueva Inglaterra. Muchos yanquis abandonaron sus fincas y migraron al oeste a Nueva York y el medio-oeste a principios del siglo XIX.
Mientras tanto, la creciente demanda de trabajadores en el siglo XIX atrajo a inmigrantes irlandeses, ingleses, italianos, y otros a las ciudades industriales. Los holandeses fueron los primeros europeos presentes en Connecticut. Los asentamientos originales de la Colonia de Connecticut estaban en Windsor en , en Wethersfield en , y en Hartford y Springfield en Esto fue el inicio del autogobierno en Connecticut. Juntaron sus milicias bajo el mando de John Mason de Windsor, y declararon la guerra a los pequot.
En , un grupo de comerciantes londinenses y sus familias, asqueados del Anglicanismo de la iglesia alta, se mudaron a Boston con fin de establecer un nuevo asentamiento. Los jefes intentaron varias empresas de bienes, pero todos fracasaron. Una gran parte de su dinero fue invertido en una gran barcaza enviada a Londres en , con libras de carga consistente en cereales y pieles de castores. La historia de la colonia de New Haven fue una serie de decepciones y fracasos.
Pero los puritanos de New Haven eran demasiado conservadores y estaban demasiado vinculados a su tierra para salir o unirse a los anglicanos en Nueva York. Cuando la colocaron en la mesa, se apagaron las velas. Porque Andros consideraba Nueva York y Massachusetts como las partes importantes de su dominio, usualmente ignoraba Connecticut.
Este acuerdo nunca realmente fue aceptado, sin embargo, y disputas fronterizas continuaron. En , un grupo de colonizadores conectiqueses fundaron la ciudad de Wilkes-Barre.
